NyxQuest: Kindred Spirits è ambientato nell'antica Grecia, una terra mitica governata da divinità capricciose. La nostra storia ha inizio quando il giovane Icaro decide di costruire delle ali di piume e cera. Icaro vola tra le nuvole, dove trova qualcosa che non avrebbe mai immaginato: un palazzo abitato da Nyx, una splendida ragazza alata, altrettanto stupita di vedere per la prima volta un essere simile a lei, un mortale con le ali! Tra i due nasce una profonda amicizia.
Convinti che il destino li vedrà uniti per sempre, i due godono della reciproca compagnia sopra le nuvole, ma Icaro, mosso dalla curiosità e dal desiderio di volare, di tanto in tanto prova l'impulso di esplorare il mondo.
Ma il destino non è sempre caritatevole con i mortali e il fato di Icaro e Nyx è nelle mani degli dei e degli antichi titani. Il conflitto tra le due fazioni non solo ha un notevole impatto sul mondo intero, ma anche sulla storia di questa amicizia. Un giorno, un'ondata di fuoco distrugge la terra e uccide tutti gli esseri viventi. Icaro, che si trovava in una delle sue missioni di esplorazione, tenta di fuggire nel cielo, verso regioni che non aveva mai raggiunto prima, dimenticando gli ammonimenti di suo padre. Così, le sue ali si sciolgono e lui cade a terra. Nyx, rendendosi conto che Icaro non sarebbe tornato da lei, decide di discendere dal cielo e di cercare il suo migliore amico in un mondo per lei ancora sconosciuto. Questo mondo le si presenta devastato, lacerato e distrutto dal conflitto tra dei e titani. Le divinità e le regole divine dell'Olimpo, inoltre, vietano a Nyx di intraprendere il viaggio per salvare il suo amico Icaro. Ma la profonda amicizia che li lega e il suo grande affetto per lui la spingono a ignorare tali regole e a scendere sulla terra distrutta alla sua ricerca.
In questo mondo così estraneo, dovrà raggiungere Icaro, che si trova in una landa desolata, impossibilitato ad andarsene. Molti pericoli e ostacoli attendono Nyx, che viaggia da sola, ma non priva di aiuto. Gli dei, per quanto inizialmente contrari alla sua avventura, osservano la coraggiosa ragazza con crescente interesse e affetto: rispettano la sua motivazione e per questo le offrono sporadici aiuti sul suo periglioso cammino.
Con l'aiuto divino, la ragazza riesce a manipolare l'ambiente alieno e ostile che la circonda e a proseguire nella ricerca dell'amico ferito.
Non solo ottiene il potere della telecinesi, ma anche il vento le obbedirà nelle fasi avanzate dell'avventura, dietro ordine di Eolo.
Pare che la mitologia greca vada considerata sotto una nuova luce. A differenza di quanto ci è stato fatto credere, l'incidente di Icaro non è stato causato dalla sventatezza di un giovane, ma da una vera e propria lotta per la sopravvivenza. Per quanto sia vero che suo padre l'avesse avvertito di non volare troppo vicino al sole, in quanto il calore avrebbe sciolto la cera delle ali, Icaro non è volato tanto in alto per avventatezza, ma per sfuggire all'ondata di fiamme provenienti dalla terra. Ecco perché, in un momento di pericolo, ha scordato l'ammonimento del padre.
Nyx farà la conoscenza del mondo degli dei e dei titani. Progredendo nel gioco, conoscerà questo mondo nel suo lato più pericoloso e dovrà continuamente adattarsi a un ambiente mutevole e ostile. Gli dei, generalmente "accusati" di aver causato la morte di Icaro in quanto contrari al suo desiderio di raggiungere il sole, aiutano Nyx nella sua missione per salvare il suo amico. Pare che gli dei non siano i vendicativi responsabili della caduta del giovane, come è credenza comune, ma d'altro canto non intervengono direttamente per salvarlo, bensì conferiscono i loro poteri a Nyx, offrendole la possibilità di salvare l'amico e riportarlo nel palazzo sulle nuvole. Chissà, magari vogliono solo osservare la bella ragazza nella sua commovente lotta per la vita di Icaro... Tuttavia, non tutte le creature celesti sono favorevoli a questa impresa. Nyx non dovrà affrontare solamente le continue minacce dell'ambiente, ma verrà anche sorvegliata dall'occhio attento e avido dei titani. Man mano che si avvicina a Icaro, i pericoli aumenteranno, tanto che anche il sole stesso sembrerà schierarsi contro di lei.
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